Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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