Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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