Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt77Q6IFZ6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms