Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms