Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms