Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CilpQ66K08 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms