Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Arhgef39Q66JY6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Arhgef39Q66JY6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Arhgef39Q66JY6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Arhgef39Q66JY6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Arhgef39Q66JY6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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