Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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