Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms