Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp4Q62445 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp4Q62445 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp4Q62445 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp4Q62445 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms