Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SypQ62277 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SypQ62277 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms