Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Six3Q62233 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Six3Q62233 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Six3Q62233 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms