Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms