Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga7Q61738 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga7Q61738 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms