Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms