Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc6Q61143 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms