Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms