Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms