Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf4Q60793 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms