Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms