Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms