Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf4Q60722 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms