Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samhd1Q60710 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms