Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HnrnpdQ60668 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms