Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpbQ60649 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms