Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp13a3Q5XF89 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms