Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms