Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myh1Q5SX40 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms