Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms