Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf215Q5SPX3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf215Q5SPX3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms