Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps41Q5KU39 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms