Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms