Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ecm2Q5FW85 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm2Q5FW85 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms