Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms