Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms