Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnah12Q3V0Q1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnah12Q3V0Q1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms