Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms