Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp48Q3V0C5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Usp48Q3V0C5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Usp48Q3V0C5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Usp48Q3V0C5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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Usp48Q3V0C5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp48Q3V0C5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms