Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9Q3V038 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms