Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed1Q3V009 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed1Q3V009 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms