Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pfdn4Q3UWL8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pfdn4Q3UWL8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Pfdn4Q3UWL8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Pfdn4Q3UWL8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Pfdn4Q3UWL8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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