Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Eb2Q3UUV9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms