Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms