Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms