Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp560Q3URI6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp560Q3URI6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms