Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vwa5b2Q3UR50 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwa5b2Q3UR50 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms