Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp30Q3UN04 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp30Q3UN04 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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