Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330014E10RikQ3UL33 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330014E10RikQ3UL33 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms