Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtpbp2Q3UJK4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms