Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms